Nedostatak mastila za bojenje je taj što nije vodootporan, a budući da se molekule boje brzo razgrađuju pod ultraljubičastim zračenjem, očigledno će izblijediti u roku od mjesec dana nakon upotrebe na otvorenom pod ultraljubičastim zračenjem.
Nedostatak je što će većina pigmentnih tinti uzrokovati ostatke materijala u boji na površini. Stoga, čak ni štampanje na sjajnom papiru i drugom papiru sa ravnom površinom ne može da štampa sjajne slike, zbog čega stvari štampane pigmentnim bojama uglavnom nemaju sjaj. Osim toga, cijena proizvodnje pigmentne tinte je veća, pa je i prodajna cijena viša od cijene tinte za bojenje, a razlika u cijeni je više od dva do četiri puta.
